Der Abschnitt Wirkungen beschreibt Wirkungsmechanismen, wobei besonders Wechselwirkungen mit Rezeptoren,Enzymen,Transportsystemen und Ionenkanälen dargestellt werden. Die Angaben beruhen sowohl auf Originalarbeiten als auch auf Fachinformationen.

Im Abschnitt Pharmakokinetik werden Daten zur Applikation, Verteilung, Metabolismus, Biotransformation und Ausscheidung zusammengefasst. Die Daten hierzu stammen in den meisten Fällen aus den Fachinformationen oder aus den Zulassungsmaterialien des BfArM und der EMA.

Als Indikationen werden die zugelassenen Anwendungsgebiete aufgeführt. Auf nicht belegte oder fragwürdige Anwendungsgebiete wird verzichtet.

In den Abschnitten Unerwünschte Wirkungen, Wechselwirkungen und Kontraindikationen sind nur die für die Anwendung wichtigen Angaben dargestellt. Die vollständigen Auflistungen finden sich in den Arzneimittel-Fachinformationen bzw. in den Zulassungsunterlagen des BfArM, der EMA oder der FDA. Zu ausführlichen Angaben zur Anwendung in der Schwangerschaft und der Stillzeit wird auf die Embryotox-Datenbank https://www.embryotox.de verwiesen.

Bei der Dosierung gilt im Allgemeinen, dass Dosisempfehlungen übersichtlich und praxisorientiert angegeben werden sollen. Deshalb werden hier mittlere Standarddosierungen für Erwachsene genannt. Für besondere Patientengruppenwie Kinder, Jugendliche und alte Menschen werden falls vorhanden ebenfalls Empfehlungen aufgeführt.

Im Abschnitt Kommentar werden zusätzliche Informationen gegeben, die dem Benutzer die Einschätzung des Stellwerts eines Arzneistoffs erleichtern sollen. Dabei werden z.B. Stellungnahmen durch das Institut für Qualitätssicherung im Gesundheitswesen (IQWiG) oder den Gemeinsamen Bundesausschuss (G-BA) ausgewertet oder Vergleiche zu anderen Wirkstoffen der gleichen Indikation in Bezug auf Wirkungen und Nebenwirkungen aus klinischen Studien herangezogen.

Handelspräparate werden jeweils am Schluss jeder Monographie genannt. Wegen der häufigen und schnellen Veränderungen und Wechsel der pharmazeutischen Unternehmer sowie der Vielzahl von Generika kann bei den meisten Arzneistoffen nur eine Auswahl aufgeführt werden.